Laboratoire Central – Microbiologie, Parasitologie-Mycologie, Sérologie

Présentation du Laboratoire Central de l’EHS CPMC

Le service du laboratoire central du CPMC comprend actuellement trois unités principales :

• Unité de microbiologie (bactériologie et virologie)
• Unité de parasitologie et mycologie
• Unité de sérologie (bactérienne, virale et parasitaire)

Deux autres unités sont en cours de validation :

• L’unité d’antibiothérapie
• L’unité de biologie moléculaire

Présentation du Chef de Service

Pr. Korchi-Ouar Mounira Rabia

• Professeure en Microbiologie à la Faculté de Pharmacie et de Médecine d’Alger (Université des Sciences de la Santé, Docteur Youcef El Khatib)
• Cheffe du service de Microbiologie et Parasitologie-Mycologie du laboratoire central de l’EHS des Maladies Cancerologiques Pierre et Marie Curie
• Présidente du comité de sécurité sanitaire des aliments auprès du ministère de la santé
• Présidente du comité pédagogique régional de spécialité de la région centre en Microbiologie
• Experte au niveau du LNCCP
• A initié et assuré la validation de l’unité de biologie moléculaire depuis 2017 à l’EHS CPMC

Personnel Médical

• Maîtres assistants :
• • Dr. Djebbourni Karima
  • Dr. Arbouz Oussama Amir

Équipe du Laboratoire

• Assistants :
• • Dr. Fouilet Aïssa
  • Dr. Bendif Zohra
  • Dr. Rahal Amine
  • Dr. Mokrani Imene
• Coordinateur :
• • M. Saim Mourad
• Résidents en formation :
• • DEMS 1 (5), Résidents R4 (4), Résidents R3 (2), Résidents R1 (6)
• Personnel technique :
• • 8 biologistes
  • 7 techniciens supérieurs en santé
• Secrétaire :
• • 01 secrétaire
• Agents polyvalents :
• • 3 agents
• Internes en pharmacie :
• • En formation

Activités du Laboratoire

1. Activité de Diagnostic

Activité de diagnostic bactériologique, virologique, parasitologique et mycologique.

Activités des Unités

Unité de Bactériologie – Parasitologie – Mycologie

Les unités sont organisées en pôles spécialisés chargés de la réalisation des différentes études cytobactériologiques (ECB) et examens microbiologiques de prélèvements.

1. Analyse des Hémocultures

• Incubation et détection rapide des flacons d’hémoculture positifs sur système automatisé.
• Types de flacons : aérobies, anaérobies et mycoses.

2. Examen Cytobactériologique du Liquide Céphalo-Rachidien (LCR)

• Prise en charge rapide du LCR : cytologie et culture.

3. Étude Cytobactériologique des Urines (ECBU)

• Cytologie et culture.

4. Étude Cytobactériologique des Prélèvements Divers

• Liquides de ponction : pleural, abdominal, biliaire, articulaire, péricardique.
• Plaies profondes et superficielles : ulcérations, suppurations profondes.
• Prélèvements respiratoires : crachats, aspirations trachéales, LBA.
• Matériel infecté : cathéters, chambres implantables, prothèses biliaires.
• Prélèvements génitaux : prélèvements de germes banaux chez les patients hospitalisés ou suivis au CPMC.

5. Copro-Parasitologie des Selles

• Culture standard : recherche de Salmonella, Shigella, et Vibrio cholerae (du 1er mai au 1er novembre, ou sur demande clinique).
• Recherche de Campylobacter à la demande du clinicien selon les signes cliniques.
• Recherche du Rotavirus et de l’Adenovirus par technique d’immunochromatographie.
• Parasitologie des selles : recherche de parasites, kystes et œufs par microscopie.

Recherches Particulières

1. Recherche du portage des Bactéries Multi-Résistantes (BMR)
2. • Réalisée chez les patients hospitalisés.
   • Recherche d’Enterobactéries productrices de BLSE et de Carbapénèmases, Staphylocoques résistants à la méticilline, et entérocoques résistants à la vancomycine.
2. Numération de la Flore Digestive à partir des selles.
3. PCR Multiplexe par Approche Syndromique
4. • Sur échantillons positifs ou selon demande clinique.
   • Types :
   • • Respiratoire (haut et bas appareil).
     • Gastro-intestinal (selles, vomissements).
4. Recherche de Clostridioides difficile dans les selles
5. • Recherche de GDH et toxines par :
   • • Technique immunochromatographique
     • Enzyme Linked Immuno Assay (VIDAS)
5. Antigène Urinaire des Légionelles
6. • Recherche par immunochromatographie dans les urines.
6. Recherche de Giardia et Cryptosporidium
7. • Recherche dans les selles par technique d’immunochromatographie.

Remarque :
Tout prélèvement positif est systématiquement soumis à une identification et un test de sensibilité aux antibiotiques par des techniques classiques et automatisées.

Études de Résistance et Hygiène Hospitalière

7. Étude de la Résistance aux Antibiotiques et Orientation Thérapeutique

• Recherche de β-lactamases à spectre élargi, carbapénèmases, et colistine.
• Étude de résistance chez les Pseudomonas et Acinetobacter.

8. Enquête d’Hygiène Hospitalière

• Réalisée dans les différents services de l’EHS en collaboration avec le comité d’hygiène et la clinique Debussy pour le suivi des infections nosocomiales.

Activité de l’Unité de Sérologie

Techniques Utilisées

1. Chimiluminescence
2. Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA)
3. Radio-Immuno Assay (RIA)
4. Western Blot (WB)

Paramètres Recherchés

1. Sérologie d’Hépatite B – HBV Complète

• Recherche des Ag et Ac : Core IgG, IgM, Anti-HBs, Ag HBs, Ac Anti-HBe, etc.
• Test de confirmation de l’antigène HBs.

2. Sérologie d’Hépatite C – HCV

• Recherche des Ac Anti-HCV.
• Recherche de l’Ag HCV en cours de mise au point.

3. VIH – Combo

• Recherche du p24 (Ag) et des anticorps VIH1/VIH2.

Autres Sérologies Réalisées

4. CMV : IgM (qualitatif) et IgG (quantitatif).
5. EBV : VCA, VEA, EBNA (qualitatif).
6. HTLV 1 et 2 : qualitatif.
7. Rubéole : IgM et IgG (quantitatif).
8. Toxoplasmose : IgM (qualitatif), IgG (quantitatif).
9. Procalcitonine : dosage.
10. Vitamine D : dosage.
11. Vitamine B12 : dosage.
12. TB-IGRA : en cours de mise au point.

Formation et Encadrement

Le laboratoire est un centre de formation pour :

• Les résidents en microbiologie (médecins et pharmaciens).
• Les internes en pharmacie.
• Les techniciens paramédicaux (TSS).